Если параметр СКД присутствует во вкладке "Параметры", то для его заполнения используем код:

&НаСервере
Процедура УстановитьПараметрВоВкладкеПараметры(НазваниеПараметра, ЗначениеПараметра)
    ЭтаФорма.Отчет.КомпоновщикНастроек.Настройки.ПараметрыДанных.УстановитьЗначениеПараметра(НазваниеПараметра, ЗначениеПараметра);
КонецПроцедуры

если же параметр СКД задан в запросе, но его нет во вкладке "Параметры", то для заполнения параметра используем следующий код:

&НаСервере
Процедура УстановитьПараметрСКД(НазваниеПараметра, ЗначениеПараметра)Параметры = КомпоновщикНастроек.Настройки.ПараметрыДанных;
Параметр = Параметры.НайтиЗначениеПараметра(Новый ПараметрКомпоновкиДанных(НазваниеПараметра));
Если Параметр <> Неопределено Тогда
    Параметр.Значение = ЗначениеПараметра;
    Параметр.Использование = Истина;
КонецЕсли;КонецПроцедуры